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2019-10 至 现在 比较正规买球的平台，教授，海洋生物研究所所长

2019-07 至 现在 比较正规买球的平台，教授，公司党总支/党委委员

2016-06 至 现在 比较正规买球的平台，教授，博士生导师

2013-09 至 2014-09 加州理工学院，国家公派访问学者

2012-01 至 2016-04 中国水产科学研究院东海水产研究所，副研究员，党支部副书记，硕士生导师

2009-07 至 2011-12 中国水产科学研究院东海水产研究所，助理研究员

担任课程：  

本科生：遗传与育种学；动物学

硕士生：海洋基因组学；水产动物性别决定与调控技术

博士生：海洋动物分子生物学；海洋基因组学；水产动物性别决定与调控技术

主要研究兴趣：   

主要从事海洋经济动物养殖、育种与生物技术研究

获奖情况：

[1]  2022-01，荣获中国产学研合作创新成果奖二等奖“青蟹优良性状遗传解析及高效养殖关键技术创建与应用”，第一完成人

[2]  2020-07，荣获上海海洋科学技术奖二等奖“锈斑蟳人工繁育与种质资源开发关键技术研究及应用”，第三完成人

[3]  2019-12，荣获中国水产科学研究院科技进步三等奖“锈斑蟳人工繁育与种质资源开发关键技术研究及应用”，第三完成人

[4]  2019-06，荣获科学中国人（2018）年度人物奖

[5]  2019-06，荣获汕头市优秀共产党员荣誉称号

[6]  2019-05，荣获汕头市“全国科技工作者日”优秀科技工作者荣誉称号

[7]  2018-12，荣获中国产学研合作创新奖

[8] 2016-05，荣获上海市优秀发明创新成果奖银奖“拟穴青蟹种质创新技术研究与应用”，第一完成人

[9] 2016-02，荣获中国水产科学研究院“先进工作者”荣誉称号

[11] 2015-11，荣获国家海洋工程科学技术奖二等奖“拟穴青蟹种质资源开发与人工繁养关键技术研究及应用”，第三完成人

[12] 2015-11，荣获上海市科技进步奖二等奖“拟穴青蟹人工繁育养殖与种质资源开发关键技术研究及应用”，第三完成人

[13] 2015-02，荣获上海市第十三届“上海市青年岗位能手”荣誉称号

[14] 2015-02，荣获上海海洋科学技术奖二等奖“拟穴青蟹种质资源发掘及改良技术的建立与应用”，第一完成人

[15] 2015-01，荣获中国水产科学研究院科技进步二等奖“拟穴青蟹遗传资源深度挖掘及辅助育种技术的建立与应用”，第一完成人

承担项目：

承担科研项目：

[1]  广东省科技计划项目（农村科技特派员），虾蟹繁育养殖关键技术创新与示范推广，主持，（编号：KTP20210376，执行期：2021.12-2024.11）

[2]  国家自然科学基金面上项目，Hox基因Ubx/Abd-A在拟穴青蟹幼体腹部变态发育过程中的功能研究，主持；（编号：42076133，执行期：2021.01-2024.12）

[3]  广东省普通高校重点领域专项项目（乡村振兴），青蟹高效繁育养殖技术示范与推广，主持；（编号：2020ZDZX1001，执行期：2021.01-2023.12）

[4]  广东省促进经济发展专项资金项目（现代渔业发展用途），青蟹全人工规模化扩繁与生态养殖技术示范推广，子课题主持；(编号：粤农2019B4，执行期：2019.06-2021.06)

[5]  广东省科技计划项目（国际科技合作领域），青蟹软壳蟹培育技术创新与示范推广，主持；(编号：2018A050506080，执行期：2018.12-2021.11)

[6]   国家重点研发计划“蓝色粮仓科技创新”重点专项子课题，拟穴青蟹基因组解析与性别特异SNP标记鉴定研究，主持；(编号：2018YFD0900201-3，执行期：2018.12-2022.12)

[7]   广东省促进经济发展专项资金项目（现代渔业发展用途），池塘工程化循环水养殖技术的创新与应用，主持；(编号：SDYY-2018-11，执行期：2018.07-2019.06)

[8]   国家自然科学基金面上项目，拟穴青蟹染色体性别决定机制研究，主持；(编号：31772837，执行期：2018.01-2021.12)

[9] 汕头市科技计划项目，拟穴青蟹池塘生态育苗技术研究与示范推广，主持；(编号：2016-44，执行期：2017.01-2018.12)

[10] 比较正规买球的平台科研启动经费项目，基于组学的拟穴青蟹性腺发育相关基因和LncRNAs鉴定与功能研究，主持；(编号：NTF17006，执行期：2017.06-2020.05)

[11] 国家留学人员科技活动择优资助项目，拟穴青蟹IGFR2基因启动子区甲基化修饰及调控mRNA转录的机制研究，主持；(编号：执行期：2015.03-2017.02)

[12] 上海市科技支撑项目，基于QTLs的拟穴青蟹分子辅助育种技术构建与应用，主持；(编号：15391900900，执行期：2015.07-2017.12)

[13] 上海市自然科学基金项目，IGF2基因多态性及其调控拟穴青蟹生长发育的分子机制研究，主持；(编号：14ZR1449700，执行期：2014.07-2017.06)

[14] 中央级科研院所基本科研业务费重点项目，采用群组和家系选育策略培育拟穴青蟹快速生长新品种，主持；(编号：2014Z01-3，执行期：2014.01-2016.12)

[15] 国家自然科学基金项目，拟穴青蟹生长性状相关分子标记、QTLs发掘及定位研究，主持；(编号：31001106，执行期：2011.01-2013.12)

[16] 中央级科研院所基本科研业务费面上项目，拟穴青蟹快速生长良种选育基础群构建，主持；(编号：2011M05，执行期：2011.10-2013.09)

承担教学项目：

[1]  比较正规买球的平台2021年度本科教学质量与教学改革工程项目，《动物学》课程多元化考核机制的创新与实践，主持

[2] 比较正规买球的平台2021年研究生课程思政项目，《海洋基因组学》，主持；(编号：2021KCSZ009，执行期：2021.09-2022.08)

[3] 比较正规买球的平台2021年春季学期校级一流课程（线下一流课程），《动物学》，主持

研究成果：

论文成果：

[1]  Ardavan Farhadi, Lv Ligang, Song Jun, Zhang Yin, Ye Shaopan, Zhang Ning, Zheng Huaiping, Li Shengkang, Zhang Yueling, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Whole-transcriptome RNA sequencing revealed the roles of chitin-related genes in the eyestalk abnormality of a novel mud crab hybrid (Scylla serrata ♀ × S. paramamosain ♂). International Journal of Biological Macromolecules, 2022, online available.

[2]  Ardavan Farhadi, Shi Xi, Zhang Yin, Zhang Yueling, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. A novel imprinted gene (Sp-Pol) with sex-specific SNP locus and sex-biased expression pattern provides insights into the gonad development of mud crab (Scylla paramamosain). Frontiers in Marine Science, 2021, 8: 727607

[3]  Ardavan Farhadi#, Huang Zhi#, Qiu Bixun, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Effect of light condition on the growth performance and biochemical compositions of post-mating female mud crab (Scylla paramamosain). Aquaculture Reports, 2021, 21:100807

[4]  Cui Wenxiao, Guan Mengyun, Md. Abu Sadek, Wu Fangchun, Wu Qingyang, Tan Huaqiang, Shi Xi, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Construction of a genetic linkage map and QTL mapping for sex indicate the putative genetic pattern of the F₁ hybrid Scylla (Scylla serrata ♀ × S. paramamosain ♂). Aquaculture, 2021, 545: 737222

[5]  Ardavan Farhadi, Fang Shaobin, Zhang Yin, Cui Wenxiao, Fang Huan, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. The significant sex-biased expression pattern of Sp-Wnt4 provides novel insights into the ovarian development of mud crab (Scylla paramamosain). International Journal of Biological Macromolecules, 2021, 183: 490-501

[6]  Ardavan Farhadi, Cui Wenxiao, Zheng Huaiping, Li Shengkang, Zhang Yueling, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. The regulatory mechanism of sexual development in decapod crustaceans. Frontiers in Marine Science, 2021, 8: 679687

[7]  Cui Wenxiao, Yang Qin, Zhang Yin, Ardavan Farhadi, Fang Huan, Zheng Huaiping, Li Shengkang, Zhang Yueling, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Integrative transcriptome sequencing reveals the molecular difference of maturation process of ovary and testis in mud crab Scylla paramamosain. Frontiers in Marine Science, 2021, 8: 658091

[8]  Zhang Yin, Wu Qingyang, Fang Shaobin, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Zhang Yueling, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. mRNA profile provides novel insights into stress adaptation in mud crab megalopa, Scylla paramamosain after salinity stress. BMC Genomics, 2020, 21: 559

[9]  Khor Waiho, Hanafiah Fazhan, Zhang Yin, Nor Afiqah-Aleng, Julia Hwei Zhong Moh, Mhd Ikhwanuddin, Marina Hassan, Mohd Husin Norainy, Ma Hongyu*. Gonadal transcriptomic analysis of the mud crab Scylla olivacea infected with rhizocephalan parasite Sacculina beauforti. Genomics, 2020, 112 (5): 2959-2969

[10]  Wu Qingyang, Khor Waiho, Huang Zhi, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Zhang Yueling, Mhd Ikhwanuddin, Lin Feng, Ma Hongyu*. Growth performance and biochemical composition dynamics of ovary, hepatopancreas and muscle tissues at different ovarian maturation stages of female mud crab, Scylla paramamosain. Aquaculture, 2020, 515: 734560

[11] Khor Waiho, Hanafiah Fazhan, Zhang Yin, Li Shengkang, Zhang Yueling, Zheng Huaiping, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Comparative profiling of ovarian and testicular piRNAs in the mud crab Scylla paramamosain. Genomics, 2020, 112 (1): 323-331

[12] Fang Shaobin, Zhang Yin, Shi Xi, Zheng Huaiping, Li Shengkang, Zhang Yueling, Hanafiah Fazhan, Khor Waiho, Tan Huaqiang, Mhd Ikhwanuddin, Hongyu Ma*. Identification of male-specific SNP markers and development of PCR-based genetic sex identification technique in crucifix crab (Charybdis feriatus) with implication of an XX/XY sex determination system. Genomics, 2020, 112 (1): 404-411

[13] Wu Qingyang, Shi Xi, Fang Shaobin, Xie Zhuofang, Guan Mengyun, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Zhang Yueling, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Different biochemical composition and nutritional value attribute to salinity and rearing period in male and female mud crab Scylla paramamosain. Aquaculture, 2019, 513: 734417

[14] Khor Waiho, Shi Xi, Hanafiah Fazhan, Li Shengkang, Zhang Yueling, Zheng Huaiping, Liu Wenhua, Fang Shaobin, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. High-density genetic linkage maps provide novel insights into ZW/ZZ sex determination system and growth performance in mud crab (Scylla paramamosain). Frontiers in Genetics, 2019, 10: 298

[15] Khor Waiho, Hanafiah Fazhan, Zhang Yin, Zhang Yueling, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Liu Wenhua, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Gonadal microRNA expression profiles and their potential role in sex differentiation and gonadal maturation of mud crab Scylla paramamosain. Marine Biotechnology, 2019, 21: 320-334

[16] Shi Xi, Lu Jianxue, Wu Qingyang, Khor Waiho , Jude Juventus Aweya, Hanafiah Fazhan, Zhang Yueling, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Lin Fan, You Cuihong, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Comparative analysis of growth performance between female and male mud crab Scylla paramamosain crablets: Evidences from a four-month successive growth experiment. Aquaculture, 2019, 505: 351-362

[17] Shi Xi, Khor Waiho, Li Xincang, Mhd Ikhwanuddin, Miao Guidong, Lin Fan, Zhang Yueling, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Liu Wenhua, Jude Juventus Aweya, Ghazali Azmie, Juliana C. Baylon, Emilia T. Quinitio, Ma Hongyu*. Female-specific SNP markers provide insights into a WZ/ZZ sex determination system for mud crab Scylla paramamosain, S. tranquebarica and S. serrata with a rapid method for genetic sex identification. BMC Genomics, 2018, 19: 981

[18] Zhang Yin, Miao Guidong, Wu Qingyang, Lin Fan, You Cuihong, Wang Shuqi, Jude Juventus Aweya, Ma Hongyu*. Transcriptome sequencing and molecular markers discovery in the gonads of Portunus sanguinolentus. Scientific Data, 2018, 5: 180131

[19] Khor Waiho, Hanafiah Fazhan, Emilia T. Quinitio, Juliana C. Baylon, Yushinta Fujaya, Ghazali Azmie, Wu Qingyang, Shi Xi, Mhd Ikhwanuddin*, Ma Hongyu*. Larval rearing of mud crab (Scylla): What lies ahead. Aquaculture, 2018, 493: 37-50

[20] Yang Xiaolong, Ikhwanuddin Mhd, Li Xincang, Lin Fan, Wu Qingyang, Zhang Yueling, You Cuihong, Liu Wenhua, Cheng Yinwei, Shi Xi, Wang Shuqi, Ma Hongyu*. Comparative transcriptome analysis provides insights into differentially expressed genes and long non-coding RNAs between ovary and testis of the mud crab (Scylla paramamosain). Marine Biotechnology, 2018, 20 (1): 20-34

[21] 马洪雨, 吴清洋, 谭华强, 吴芳春, 林锋. 青蟹种间人工杂交技术建立及杂种子一代表型和遗传特征鉴定. 比较正规买球的平台学报（自然科学版）, 2021, 36 (2): 59-66

[22] 马洪雨, 吴清洋, 林锋, 张建生, 石西, 邱丽华, 范嗣刚. 拟穴青蟹室内水泥池高效人工育苗技术研究. 科学养鱼, 2021, 2: 65-66

[23] 吴清洋, 林锋, 石西, 张建生, 邱丽华, 范嗣刚, 马洪雨*. 拟穴青蟹池塘生态高效养殖技术研究. 科学养鱼, 2020, 7: 62-63

[24] 马洪雨, 谭华强, 方少彬, 黄智, 沈卓辉, 沈卓坤, 张建生, 张健彬, 林锋, 吴清洋, Mhd Ikhwanuddin. 青蟹陆基高密度循环水养殖技术的建立与应用. 科学养鱼, 2019, 12: 61-63

[25] 马洪雨, 吴清洋, 石西, 张建生, 陆建学, 夏连军. 拟穴青蟹池塘生态育苗技术研究. 科学养鱼, 2019, 2: 12-13

专利成果：

[1]  马洪雨，方少彬，管梦云，苗贵东，石西. 一种快速鉴定锈斑蟳性别特异分子标记和遗传性别的方法，国家发明专利，2022.02，ZL201810572161.6

[2]  马洪雨，吴清洋，谭华强，方少彬，牛泽瑶，黄智. 一种拟穴青蟹与锯缘青蟹人工定向杂交方法，国家发明专利，2022.01，ZL202010152729.6

[3]  马洪雨，吴清洋，石西. 一种拟穴青蟹蚤状幼体和大眼幼体的池塘培育方法，国家发明专利，2021.09，ZL201910022494.6

[4]  马洪雨，苗贵东，游翠红，杨小龙，程银伟，章跃陵，石西. 一种用于拟穴青蟹性别鉴定的SNP位点及其鉴定方法，国家发明专利，2020.11，ZL201710252419.X

[5] 马洪雨，吴清洋，苗贵东，郑怀平，李升康，游翠红，王树启. 一种远海梭子蟹多态性微卫星分子标记及鉴定方法与应用，国家发明专利，2020.08，ZL201711267397.0

[6]  马洪雨，夏连军，邹雄，马凌波，马春艳，陆建学，蒋伟，李淑娟，刘月星. 一种锈斑蟳微卫星标记的快速检测方法，国家发明专利，2015.04，ZL201310211317.5

[7]  马洪雨，夏连军，邹雄，马凌波，马春艳，陆建学，蒋伟，李淑娟，刘月星. 一种锈斑蟳微卫星分子标记的筛选方法，国家发明专利，2015.03，ZL201310210311.6

[8]  马洪雨，崔海玉，马凌波，马春艳. 一种拟穴青蟹微卫星分子标记的筛选方法，国家发明专利，2012.12，ZL201010575043.4

[9]  马洪雨，马凌波，马春艳. 一种快速鉴定青蟹属4种青蟹的PCR方法，国家发明专利，2012.08，ZL201010140012.6

[10] 马洪雨，马凌波，马春艳. 拟穴青蟹功能基因来源微卫星标记的快速检测方法，国家发明专利，2012.03，ZL201010134061.9

教学成果：

[1] 指导的本科生科技项目“育蟹者说—软壳蟹培育开拓者”荣获2022年“挑战杯”比较正规买球的平台员工创业大赛银奖（全校第4名，乡村振兴和产业发展类别第一名），晋级广东省省赛—第十三届“挑战杯”广东大员工创业计划竞赛。（指导教师：马洪雨、陈小涵）

[2] 指导的研究生科技项目“一种高效培育海洋经济蟹类高端产品的新模式”荣获2021年广东“众创杯”创业创新大赛科技海归领航赛粤东西北赛区团队组优秀奖（第一名），晋级省级复赛。（指导教师：马洪雨）

[3] 指导的本科生科技项目“青蟹胰岛素样促雄性腺激素受体鉴定及其在性腺分化中的功能研究”荣获全国大员工生命科学竞赛（2021）广东赛区三等奖。（指导教师：马洪雨）

[4] 指导的研究生科技项目“一种高效培育海洋经济蟹类高端产品的新模式”荣获2021年“创客广东”汕头市中小企业创新创业大赛暨第二届“创客汕头”大赛金奖（第一名），晋级广东省决赛后荣获第六届“创客中国”广东省中小企业创新创业大赛暨第五届“创客广东”大赛优胜奖。（指导教师：马洪雨、张银）

[5] 指导的本科生科技项目“spa-miR-35调控Spfru2基因在拟穴青蟹卵巢发育中的作用机制研究”荣获2021年大员工创新创业训练计划项目省级立项。（指导教师：马洪雨）

[6] 指导的本科生科技项目“拟穴青蟹生长性状的全基因组关联分析及候选基因的功能验证”荣获2021年大员工创新创业训练计划项目校级立项。（指导教师：叶绍潘、马洪雨）

[7] 指导的研究生科技项目“一种高效培育海洋经济蟹类高端产品的新模式”荣获第七届中国国际“互联网+”大员工创新创业大赛高教主赛道比较正规买球的平台校级选拔赛研究生创意组银奖，晋级第七届中国国际“互联网+”大员工创新创业大赛省级复赛。（指导教师：马洪雨）

[8] 指导的博士生石西和硕士生方少彬荣获2019年度研究生国家奖学金。（指导教师：马洪雨）

[9] 指导的本科生科技项目“拟穴青蟹TWIST和MEF2基因克隆、时空表达及调控关系研究”荣获2019年大员工创新创业训练计划项目省级立项，并获得结题优秀等次。（指导教师：马洪雨）

[10] 指导的硕士生谢卓芳和管梦云获得2018年研究生学业奖学金一等奖学金。（指导教师：马洪雨）

[11] 指导的博士生张银和硕士生谢卓芳获得2018年度研究生国家奖学金。（指导教师：马洪雨）